В 1998 году заведующим кафедрой экологии стал кандидат ветеринарных наук, доцент Александр Викторович Никитин, занимавшийся вопросами воздействия антропогенных факторов на биотический круговорот в аграрных ландшафтах и их влиянием на продуктивность и здоровье сельскохозяйственных животных.
В 1999–2002 годах кафедрой руководил доктор ветеринарных наук, профессор Василий Петрович Толоконников, под его руководством на основе научных исследований в области экологической паразитологии были разработаны: Устройство для культивирования и стерилизации вольфартовой мухи; Устройство для обработки животных.
С 2002 года по 2015 год кафедру возглавляла доктор биологических наук, доцент Изольда Олеговна Лысенко. В 2007 году кафедра экологии была переименована в кафедру экологии и ландшафтного строительства. С 2002 года кафедра стала выпускающей для новых перспективных специальностей (020802.65 – «Природопользование», 030500.10 – «Профессиональное обучение», 280402.65 – «Природоохранное обустройство территорий»), которые были открыты на базе Ставропольского государственного аграрного университета. А уже в 2006 году началась подготовка студентов по востребованной во всем мире специальности 250203.65 – «Садово-парковое и ландшафтное строительство».
В 2007 году кафедра экологии была переименована в кафедру экологии и ландшафтного строительства. С 2009 года на кафедре ведется подготовка бакалавров по направлениям «Ландшафтная архитектура», «Экология и природопользование», а в 2010 году – открыта магистратура по направлению подготовки – «Экология и природопользование», в рамках которой сегодня функционируют две магистерские программы: «Агроэкологический мониторинг» и «Инновационные технологии в сфере энергосбережения и экологического контроля».
В 2015 – 2017 годах заведующей кафедрой стала кандидат биологических наук, доцент Юлия Александровна Мандра, с 2017 по 2019 - кандидат биологических наук, доцент Светлана Васильевна Окрут.
С первых дней организации кафедры в ее составе работали высококвалифицированные преподаватели. Среди них: доктор сельскохозяйственных наук, профессор В.М. Горяинов; доктор химических наук, профессор Н.И. Корнилов; доктор технических наук, доцент С.А. Емельянов, доценты – кандидат биологических наук Е.Г. Мишвелов, кандидат ветеринарных наук А.В. Вакуленко; кандидат географических наук А.А. Кондратьева; кандидат сельскохозяйственных наук О.А. Поспелова; старшие преподаватели - А.А. Коршиков; кандидат биологических наук Р.С. Еременко, кандидат сельскохозяйственных наук Н.Н. Васильева; ассистенты Р.А. Кубрина, К.И. Шуляк, А.К. Карагодин, А.С. Гуськов, В.И. Линник, С.Г. Журавлева, Т.А. Кознеделева, Ю.Ю. Небогина, А.Г. Ермолова, В.Ю. Закрасняная, А.О. Касаткина, А.С. Шкиря, В.А. Халикова, А.В. Мурадова.
Творческий потенциал коллектива позволил подготовить ряд научных, учебно-методических и практических разработок, направленных на поддержание устойчивого экономического развития Ставропольского края и России в целом. Получено пять охранных документов на научно-исследовательскую продукцию, опубликованы семь монографий («Оводовые болезни животных», «Биология и экология диких копытных Ставрополья и их влияние на экосистемы особо охраняемых природных территорий при вольном и полувольном содержании и разведении», «Физиологические основы формирования урожая и качества зерна пшеницы», «Система интегрированной защиты сельскохозяйственных культур от сорных растений, вредителей и болезней», «Научные основы экологической паразитологии», «Развитие экологического туризма в Ставропольском крае», «Классификация природных минеральных вод хлоридно-гидрокарбонатного типа»).
