В ноябре 1984 года ректором Cтавропольского сельскохозяйственного института стал доктор ветеринарных паук, профессор, заслуженный деятель науки РСФСР Виктор Яковлевич Никитин. Закончив среднюю школу в Мордовии, он в 1947 году поступил в Казанский ветеринарный институт им. Баумана, по окончании которого стал сотрудником одной из его кафедр. Затем несколько лет он работал в Дагестанском сельскохозяйственном институте. В 1961 году Виктор Яковлевич был принят доцентом кафедры акушерства, гинекологии и искусственного осеменения в Cтавропольский сельскохозяйственный институт. Возглавив кафедру, доцент В.Я. Никитин не ограничился научной работой. Изучая мастит овец и методы борьбы с ним, он всячески пропагандировал результаты своих исследований, неутомимо внедрил их в производство, читал лекции в хозяйствах края о борьбе с маститами овец и яловостью, проводил семинары и беседы с животноводами.
С 1985 года в вузе стали обучаться аспиранты из Египта, Индии, Алжира, Ирака, Болгарии, Монголии, Лаоса, Гвинеи, Сирии и Бангладеш. В 1989-90 учебном году на ветеринарном факультете обучались 33 студента из 12 стран Азии, Африки и Латинской Америки. В следующем учебном году число студентов из-за рубежа возросло до 58 человек из 20 стран.
В те годы начался обмен группами студентов для прохождения производственной практики в США, Канаде и Европе. Впервые студенты Ставропольского сельскохозяйственного институт были направлены заграницу для прохождения полного курса обучения. Ими стали ребята с зооинженерного и экономического факультетов, отправившиеся в Венгрию. А осенью 1992 года иностранные студенты стали впервые обучаться на подготовительном отделении Ставропольского сельскохозяйственного института. Ими стали 70 юношей и девушек из Индии и Иордании. Первый выпуск иностранных студентов состоялся в вузе в июле 1994 года. Дипломы ветеринарных врачей со степенью магистра ветеринарных наук получили 32 иностранных студента из 13 стран Азии, Африки и Латинской Америки, четверо из которых заключили контракт о продолжении учебы в аспирантуре. Финансовая ситуация и резко возросшие требования к качеству подготовки специалистов высшей квалификации не могли не привести к сокращению набора в институт. Если в 1985 году было зачислено 875 человек, то в 1989 - 800, в 1990 - 700.
Уверенный старт в условиях рыночных отношений взял факультет повышения квалификации. В 1991 году, когда он стал функционировать на принципах хозяйственного расчета и финансирования, уровень рентабельности этого подразделения вуза составил 15 процентов. С целью расширения традиционной для факультета сферы деятельности по повышению квалификации в области апробации сельскохозяйственных культур, бухгалтерского учета, применения электроэнергии в сельском хозяйстве началась организация краткосрочных семинаров по ряду узких специализаций.
В 1992 году начались обучение жителей городов и сел Ставрополья в школе фермеров. Занятия с желающими получить фермерское образование стали проводить ведущие ученые вуза. В марте того же года эту школу окончили 15 слушателей.
Тогда же в институте открылся фермерский факультет, куда на платной основе поступили 40 человек из ряда районов края. В течение года на лекциях и практических занятиях они осваивали различные сельские специальности, чтобы стать высококвалифицированными специалистами. Параллельно продолжалась и подготовка студентов-старшекурсников на месячных курсах фермеров.
Об укреплении с началом перестройки кадрового состава ученых свидетельствует тот факт, что если в 1985 году в вузе работали 12 докторов наук, то в 1990 — уже вдвое больше. Причем средний возраст профессоров снизился за этот период с 66 до 57 лет.
Высокий уровень учебной и научной работы в вузе был подтвержден выводами Государственной аттестационной комиссии Государственной инспекции по аттестации учебных заведений России, которая в ноябре 1993 года поддержала решение Ученого совета Ставропольского сельскохозяйственного института об изменении статуса высшего учебного заведения. К этому времени институт стал одним из лучших сельскохозяйственных вузов России, опередив большинство их по основным показателям учебной и научной деятельности. 27 апреля 1994 года Государственный комитет по высшему образованию принял решение с преобразовании Ставропольского сельскохозяйственного института в Ставропольскую государственную сельскохозяйственную академию.
